Dos tipos de logos para "THE END OF EVANGELION" fueron diseñados. Uno utilizado en el poster y en el ticket de entrada al cine. Otro utilizado en el título de la película, siguiendo el estilo de mano escrita usado en el título de "Rebirth". Es el mismo logo utilizado en la portada deste libro.

La base de la película capítulo 25 "Aria" es el quión que originalmente iba a ser utilizado como el capítulo 25 de la serie de televisión. Por varios problemas durante la producción, este guión no fue utilizado y el cap. de TV 25 "El fin del mundo" fue hecho de igual manera que el cap. 26 en donde el drama fue desarrollado en el mundo interior de la mente. Por esto, se puede decir que el capítulo 25 "Aria" es la verdadera continuación del guión original. En contraste, la película capítulo 26, cuando comparada al cap. de TV 26, tiene mucho más contenido en la historia y en el argumento, profundizando el tema utilizado en la televisión.

Como esta película se supone que es la reedición de los dos últimos capítulos de la serie de TV, el formato de capítulo de TV es seguido, con cada capítulo teniendo sus propios subtítulos y escenas de ojo rápido (aquellas escenas estáticas que continen solo un fondo negro y letras blancas en japonés/inglés que no duran más de unos milisegundos).

La producción de la animación de esta película fue hecha con la ayuda de PRODUCTION I.G., el cual es conocido por haber producido películas de anime como "Patlabor 2 La película" y "Ghos in the Shell". PRODUCTION I.G. hizo un gran esfuerzo en las composiciones gráficas en esta película, para que esta se tornara una película de gran calidad fílmica.

En la película cap. 25 "Aria", el director fue Katsuya Tsurumaki, el cual debutó como director en algunos capítulos de la serie de televisión. Apesar de que el guión viene directamente de las manos del jefe director Hideaki Anno, todas las operaciones secundarias tienen generalmente la coordinación de Masayuki Tsurumaki, además de su debut como director en la serie de televisión, es el responsable por el storyboarding de la animación (las historietas hechas a lápiz mostrando solo las escenas para que los animadores se guien). Además, se contó con la ayuda de Shinji Higuchi en el guión y en la elaboración de los rascuños para la animación. Todo el equipo siguió las órdenes del director Tsurumaki.

La dirección de la película cap. 26 "Sinceridad para ti" fue tomada por el propio director jefe Anno. Por esto, en la película se siente su fuerte estilo individual. Para los rascuños de animación también se contó con la ayuda de Jime Kiichi y Higuchi Shinji.